El intrépido dúo conformado por Ratchet y Clank fue capaz de detener la amenaza de los Cragmites, pero al final de esta aventura el pequeño robot fue separado de su inseparable amigo al ser transportado a otra galaxia por la misteriosa tribu Zoni. Algunos años han pasado y ahora es deber del valiente Lombax encontrarle y salvar al universo de una nueva amenaza creada por el Dr. Nefarious. ¿Que secretos esconde el intrigante cuerpo de Clank? ¿Cual es el verdadero destino de Ratchet?¿Sera acaso que este par se separará drasticamente?

Utilizando la mecánica de juego de Tools Of Destruction, Crack In Time introduce un gran numero de mejoras que se ven reflejadas en una mayor variedad de retos dentro del universo del título. Al no estar atado a la espalda del Lombax, el robot puede utilizar su nuevo bastón mágico para detener el tiempo y crear copias holográficas de su persona. Por otra parte Ratchet estrena un imponente arsenal en el cual puedes encontrar desde un potente rifle de plasma con mira de precisión hasta un bizarro pez que eructa ondas sónicas de alta frecuencia.