Esta cuarta entrega de la serie Profesor Layton comienza una nueva trilogía que a su vez es una precuela de los juegos originales. Tres años antes de los acontecimientos en el profesor Layton y la Villa Misteriosa, el profesor Layton recibe una carta de su antiguo compañero de escuela Clark Triton. Que solo dice que “un gigante misterioso envuelto en la niebla ha arrasado con nuestras casas.”

El profesor se dirige a la ciudad de Misthallery para investigar, y se une a Emmy, su nuevo asistente. ¿Cuál es el significado de toda la destrucción, y como se relaciona con la leyenda del folclore del pueblo. ¿Acaso será un “fantasma”?

Los jugadores se mueven en una misteriosa historia presentada mediante la resolución de una multitud de enigmas y acertijos. Este juego contiene más puzzles que cualquier otro juego de la serie hasta ahora.

Los jugadores pueden obtener como bono el de juego de Professor Layton en Londres que contiene mas de 100 horas de contenido adicional.