Como en entregas anteriores, el protagonista de nuestra aventura se ha convertido en un pokemon, que en esta ocasión podremos elegir entre 20 distintos. Nuestro futuro compañero de viaje también será escogido entre esos 20 pokémon, y juntos podremos irnos de aventuras para intentar encontrar a los 720 pokémon, incluyendo legendarios o singulares.