A pesar de lo sencillo del género, NC4 ofrece una amplia variedad de opciones. El juego ofrece hasta 17 personajes a seleccionar, comenzando con 5 (Kakashi, Rock Lee, Sakura, Neiji, y Naruto). La historia se presenta acorde a la perspectiva del personaje que selecciones, lo que da amplio replay value. Cada uno tiene diferentes poderes especiales, sus Jutsu?s, que se activan utilizando el stylus de diferentes formas. La pantalla inferior también permite explorar un mapa de los vastos niveles presentes en el juego, que una vez terminados se pueden volver a recorrer en dificultades superiores.